Les traditions académiques à Cracovie remontent au XIVe siècle. Déjà en 1364, le roi Casimir le Grand a fondé l’Académie de Cracovie qui, après la restauration en 1400, restait la source de la force intellectuelle de la ville. C’est une des universités les plus anciennes en Europe Centrale, la seconde après l’Université de Charles à Prague. Parmi les diplômés de l’Université de Cracovie, il y a Mikołaj Kopernik, l’astronome et l’auteur de la théorie héliocentrique et Karol Wojtyła qui, après être élu Pape, a pris le nom Jean-Paul II. L’Université connue depuis le XIXe siècle comme l’Université Jagellonne, joue, jusqu’à présent, un rôle fondamental parmi les nombreuses universités cracoviennes. Actuellement, parmi les universités de Cracovie qu’il faut citer il y a: l’Académie des Mines et de la Métallurgie, l’École d’Ingénieurs de Cracovie, l’Université Économique, et l’Académie des Beaux-Arts – la première université artistique en Pologne. L’institution la plus ancienne des sciences et des recherches est l’Académie Polonaise des Sciences et des Lettres continuant le travail de l’Association Cracovienne de la Science fondée en 1815.